13 डिसेंबर 2019 रोजी अलिगड मुस्लिम विद्यापीठात प्रक्षोभक भाषण देण्याच्या आरोपाखाली डॉ. कफील यांना यावर्षी जानेवारीत मुंबईतून अटक करण्यात आली होती.